La sede del Club Náutico San Esteban se encuentra en San Esteban, en un edificio propiedad de Puertos del Principado de Asturias.

El edificio consta de dos plantas, en la primera planta se encuentran las oficinas del Club, sala de espera y sala polivalente.

En la planta baja se encuentra baños con duchas para los navegantes en situación de tránsito, para los socios del NSE, baño de discapacitados, lavandería y almacén.

El club se encuentra próximo al edificio de Junta de Obras del Puerto.